前天我们说到了吐鲁番吐鲁番油浸式变压器比普通吐鲁番吐鲁番油浸式变压器有其自身的优化，那么在系统中采用吐鲁番吐鲁番油浸式变压器的缺点又是什么呢？
在有其自身优化点的同时，肯定也存在一定的缺点，其缺点表现在：
1)使绕组的过电压保护复杂。由于高、中压绕组的联系，当任一侧落入一个波幅与该绕组绝缘水平相适应的雷电冲击波时，另一侧出现的过电压冲击的波幅则可能超出该绝缘水平。为了避免这种现象的发生，必须在高、中压两侧出线端都装一组阀型避雷器。
2)使系统短路电流增加。由于吐鲁番油浸式变压器的高、中压绕组之间有电的联系，其短路阻抗只有同容量普通双绕组吐鲁番油浸式变压器的(1-k/1)平方倍，因此在系统中采用吐鲁番油浸式变压器后，将使短路电流显著增加。又由于吐鲁番油浸式变压器中性点必须直接接地，所以将使系统的单相短路电流大为增加，有时甚至超过短路电流。
3)使继电保护复杂。
4)造成调压困难。主要也是因其高、中压绕组有电的联系引起的目前吐鲁番油浸式变压器可能的调压方式有三种，种是在吐鲁番油浸式变压器绕组内部装设带负荷改变分头位置的调压装置;第二种是在高压与中压线路上装设附加吐鲁番油浸式变压器。而这三种方法不仅是制造上存在困难，不经济，且在运行中也有缺点(如影响第三绕组的电压)，解决得都不够理想。
尽管吐鲁番油浸式变压器存在着这些的缺点，但它在电网中起到的作用也是不可替代的，因为系统向大容量高电压的发展，各国还是非常重视吐鲁番油浸式变压器的应用，随着容量增大，电压升高，吐鲁番油浸式变压器的优点就更为突出。
